Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn2O88552 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms