Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cops6O88545 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cops6O88545 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cops6O88545 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cops6O88545 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cops6O88545 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cops6O88545 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cops6O88545 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cops6O88545 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cops6O88545 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cops6O88545 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cops6O88545 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cops6O88545 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops6O88545 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops6O88545 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops6O88545 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cops6O88545 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms