Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctnnal1O88327 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnal1O88327 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms