Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Smpd2O70572 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smpd2O70572 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd2O70572 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd2O70572 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms