Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hcn4O70507 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn4O70507 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms