Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtssO70370 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtssO70370 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtssO70370 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtssO70370 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CtssO70370 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CtssO70370 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtssO70370 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtssO70370 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CtssO70370 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtssO70370 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtssO70370 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtssO70370 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtssO70370 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtssO70370 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtssO70370 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtssO70370 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtssO70370 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CtssO70370 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtssO70370 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtssO70370 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtssO70370 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtssO70370 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtssO70370 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtssO70370 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtssO70370 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtssO70370 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtssO70370 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtssO70370 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtssO70370 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtssO70370 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtssO70370 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtssO70370 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtssO70370 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtssO70370 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtssO70370 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtssO70370 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtssO70370 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtssO70370 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtssO70370 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtssO70370 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtssO70370 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtssO70370 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtssO70370 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtssO70370 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtssO70370 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtssO70370 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtssO70370 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtssO70370 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtssO70370 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtssO70370 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtssO70370 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtssO70370 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtssO70370 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtssO70370 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtssO70370 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtssO70370 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtssO70370 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtssO70370 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtssO70370 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtssO70370 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtssO70370 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtssO70370 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtssO70370 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtssO70370 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtssO70370 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtssO70370 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtssO70370 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtssO70370 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtssO70370 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtssO70370 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtssO70370 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtssO70370 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtssO70370 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtssO70370 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtssO70370 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtssO70370 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CtssO70370 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtssO70370 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtssO70370 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtssO70370 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtssO70370 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms