Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nptx2O70340 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nptx2O70340 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms