Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap2O55126 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms