Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trdmt1O55055 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trdmt1O55055 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trdmt1O55055 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trdmt1O55055 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trdmt1O55055 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trdmt1O55055 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trdmt1O55055 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trdmt1O55055 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms