Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc3O55013 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3O55013 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms