Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sema6bO54951 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema6bO54951 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema6bO54951 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms