Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NlkO54949 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NlkO54949 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NlkO54949 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NlkO54949 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NlkO54949 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NlkO54949 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NlkO54949 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NlkO54949 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NlkO54949 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NlkO54949 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NlkO54949 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NlkO54949 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NlkO54949 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NlkO54949 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NlkO54949 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NlkO54949 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NlkO54949 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NlkO54949 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NlkO54949 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NlkO54949 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NlkO54949 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NlkO54949 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NlkO54949 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NlkO54949 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NlkO54949 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NlkO54949 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NlkO54949 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NlkO54949 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NlkO54949 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NlkO54949 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NlkO54949 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NlkO54949 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NlkO54949 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NlkO54949 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NlkO54949 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NlkO54949 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NlkO54949 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NlkO54949 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NlkO54949 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NlkO54949 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NlkO54949 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NlkO54949 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms