Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxO54751 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxO54751 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxO54751 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxO54751 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxO54751 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrxO54751 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrxO54751 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrxO54751 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxO54751 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxO54751 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxO54751 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxO54751 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxO54751 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxO54751 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxO54751 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxO54751 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxO54751 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxO54751 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxO54751 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxO54751 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxO54751 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxO54751 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxO54751 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxO54751 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxO54751 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxO54751 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxO54751 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxO54751 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxO54751 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxO54751 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxO54751 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxO54751 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxO54751 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxO54751 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxO54751 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxO54751 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxO54751 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxO54751 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxO54751 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxO54751 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxO54751 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxO54751 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms