Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Per1O35973 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Per1O35973 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Per1O35973 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Per1O35973 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Per1O35973 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Per1O35973 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Per1O35973 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Per1O35973 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Per1O35973 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Per1O35973 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Per1O35973 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Per1O35973 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Per1O35973 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Per1O35973 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Per1O35973 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Per1O35973 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Per1O35973 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Per1O35973 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Per1O35973 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Per1O35973 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Per1O35973 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Per1O35973 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Per1O35973 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Per1O35973 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Per1O35973 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Per1O35973 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Per1O35973 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Per1O35973 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Per1O35973 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Per1O35973 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Per1O35973 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Per1O35973 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Per1O35973 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Per1O35973 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Per1O35973 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Per1O35973 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Per1O35973 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Per1O35973 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Per1O35973 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Per1O35973 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Per1O35973 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Per1O35973 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Per1O35973 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Per1O35973 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Per1O35973 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Per1O35973 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Per1O35973 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Per1O35973 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Per1O35973 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Per1O35973 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Per1O35973 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Per1O35973 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Per1O35973 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Per1O35973 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Per1O35973 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Per1O35973 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Per1O35973 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Per1O35973 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Per1O35973 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Per1O35973 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Per1O35973 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Per1O35973 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Per1O35973 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Per1O35973 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Per1O35973 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Per1O35973 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Per1O35973 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Per1O35973 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Per1O35973 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Per1O35973 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Per1O35973 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Per1O35973 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Per1O35973 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Per1O35973 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Per1O35973 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Per1O35973 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Per1O35973 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Per1O35973 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Per1O35973 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Per1O35973 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Per1O35973 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Per1O35973 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Per1O35973 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Per1O35973 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Per1O35973 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Per1O35973 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Per1O35973 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Per1O35973 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Per1O35973 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Per1O35973 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Per1O35973 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Per1O35973 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Per1O35973 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Per1O35973 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Per1O35973 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Per1O35973 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Per1O35973 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Per1O35973 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Per1O35973 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms