Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops5O35864 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops5O35864 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops5O35864 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops5O35864 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops5O35864 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops5O35864 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops5O35864 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops5O35864 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops5O35864 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cops5O35864 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops5O35864 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops5O35864 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops5O35864 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops5O35864 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops5O35864 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cops5O35864 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops5O35864 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms