Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppfibp2O35711 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppfibp2O35711 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms