Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptlc1O35704 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc1O35704 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc1O35704 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc1O35704 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc1O35704 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc1O35704 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc1O35704 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc1O35704 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc1O35704 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms