Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn1mwO35599 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn1mwO35599 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms