Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edil3O35474 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edil3O35474 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edil3O35474 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Edil3O35474 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Edil3O35474 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edil3O35474 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edil3O35474 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edil3O35474 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edil3O35474 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Edil3O35474 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edil3O35474 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edil3O35474 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edil3O35474 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms