Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn6O35454 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Clcn6O35454 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Clcn6O35454 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn6O35454 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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