Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abcc1O35379 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc1O35379 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc1O35379 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc1O35379 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms