Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad6O35182 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad6O35182 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad6O35182 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad6O35182 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad6O35182 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad6O35182 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad6O35182 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad6O35182 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad6O35182 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad6O35182 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad6O35182 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms