Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GclmO09172 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GclmO09172 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GclmO09172 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GclmO09172 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GclmO09172 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GclmO09172 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GclmO09172 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GclmO09172 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GclmO09172 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GclmO09172 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GclmO09172 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GclmO09172 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GclmO09172 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GclmO09172 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GclmO09172 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GclmO09172 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GclmO09172 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GclmO09172 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GclmO09172 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GclmO09172 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GclmO09172 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GclmO09172 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GclmO09172 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GclmO09172 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GclmO09172 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GclmO09172 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GclmO09172 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GclmO09172 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GclmO09172 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GclmO09172 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GclmO09172 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GclmO09172 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GclmO09172 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GclmO09172 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GclmO09172 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GclmO09172 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GclmO09172 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GclmO09172 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GclmO09172 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GclmO09172 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GclmO09172 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GclmO09172 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GclmO09172 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GclmO09172 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GclmO09172 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GclmO09172 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GclmO09172 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GclmO09172 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GclmO09172 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GclmO09172 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GclmO09172 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GclmO09172 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GclmO09172 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GclmO09172 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GclmO09172 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GclmO09172 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GclmO09172 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GclmO09172 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GclmO09172 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GclmO09172 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GclmO09172 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GclmO09172 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GclmO09172 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GclmO09172 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GclmO09172 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GclmO09172 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GclmO09172 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GclmO09172 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GclmO09172 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GclmO09172 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GclmO09172 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GclmO09172 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GclmO09172 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GclmO09172 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GclmO09172 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GclmO09172 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GclmO09172 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GclmO09172 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GclmO09172 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GclmO09172 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GclmO09172 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GclmO09172 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GclmO09172 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GclmO09172 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GclmO09172 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GclmO09172 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GclmO09172 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GclmO09172 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GclmO09172 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GclmO09172 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GclmO09172 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GclmO09172 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GclmO09172 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GclmO09172 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GclmO09172 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GclmO09172 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GclmO09172 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GclmO09172 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GclmO09172 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms