Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcshO08795 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms