Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CltaO08585 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CltaO08585 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CltaO08585 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CltaO08585 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CltaO08585 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CltaO08585 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CltaO08585 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltaO08585 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltaO08585 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltaO08585 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltaO08585 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CltaO08585 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltaO08585 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CltaO08585 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CltaO08585 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CltaO08585 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltaO08585 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltaO08585 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltaO08585 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltaO08585 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CltaO08585 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CltaO08585 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CltaO08585 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CltaO08585 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CltaO08585 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltaO08585 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltaO08585 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltaO08585 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CltaO08585 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltaO08585 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CltaO08585 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltaO08585 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltaO08585 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CltaO08585 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CltaO08585 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltaO08585 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltaO08585 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltaO08585 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltaO08585 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltaO08585 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltaO08585 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltaO08585 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltaO08585 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltaO08585 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltaO08585 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltaO08585 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltaO08585 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltaO08585 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltaO08585 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltaO08585 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltaO08585 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CltaO08585 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CltaO08585 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltaO08585 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltaO08585 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltaO08585 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltaO08585 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CltaO08585 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CltaO08585 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltaO08585 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CltaO08585 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltaO08585 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltaO08585 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltaO08585 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltaO08585 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltaO08585 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltaO08585 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltaO08585 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltaO08585 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CltaO08585 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CltaO08585 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CltaO08585 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CltaO08585 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CltaO08585 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CltaO08585 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CltaO08585 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CltaO08585 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CltaO08585 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CltaO08585 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CltaO08585 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CltaO08585 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CltaO08585 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CltaO08585 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CltaO08585 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CltaO08585 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CltaO08585 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CltaO08585 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CltaO08585 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CltaO08585 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CltaO08585 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CltaO08585 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CltaO08585 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CltaO08585 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CltaO08585 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CltaO08585 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CltaO08585 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CltaO08585 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CltaO08585 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CltaO08585 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms