Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Usp35M0QWN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Usp35M0QWN7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Usp35M0QWN7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Usp35M0QWN7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Usp35M0QWN7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp35M0QWN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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Usp35M0QWN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Usp35M0QWN7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Usp35M0QWN7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Usp35M0QWN7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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Usp35M0QWN7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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Usp35M0QWN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp35M0QWN7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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