Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3488M0QW81 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3488M0QW81 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms