Protein–RNA interactions for Protein: L7N296

Gm3739, Predicted gene 3739, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3739L7N296 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3739L7N296 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3739L7N296 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3739L7N296 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3739L7N296 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3739L7N296 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms