Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20878L7N244 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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