Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r88L7N1W8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r88L7N1W8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms