Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ59

Gm3383, Predicted gene 3194, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3383J3QQ59 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3383J3QQ59 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3383J3QQ59 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms