Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm379J3QQ19 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm379J3QQ19 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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