Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm2035J3QP87 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2035J3QP87 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms