Protein–RNA interactions for Protein: J3QNZ6

Gm21874, Predicted gene, 21874, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21874J3QNZ6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm21874J3QNZ6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm21874J3QNZ6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21874J3QNZ6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21874J3QNZ6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21874J3QNZ6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21874J3QNZ6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm21874J3QNZ6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21874J3QNZ6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21874J3QNZ6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm21874J3QNZ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21874J3QNZ6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm21874J3QNZ6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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