Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm17577J3QNF7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm17577J3QNF7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm17577J3QNF7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17577J3QNF7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm17577J3QNF7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm17577J3QNF7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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