Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sclt1G5E861 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms