Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Pcf11G3X9Z4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pcf11G3X9Z4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms