Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm28038F7BCN9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm28038F7BCN9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm28038F7BCN9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28038F7BCN9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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