Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syngap1F6SEU4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms