Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms