Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdhr2E9Q7P9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdhr2E9Q7P9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdhr2E9Q7P9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms