Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Urb2E9Q7L1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Urb2E9Q7L1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms