Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8882E9Q7E4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8882E9Q7E4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8882E9Q7E4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8882E9Q7E4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8882E9Q7E4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8882E9Q7E4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8882E9Q7E4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8882E9Q7E4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8882E9Q7E4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8882E9Q7E4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8882E9Q7E4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms