Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtproE9Q612 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtproE9Q612 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms