Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancfE9Q5Z5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FancfE9Q5Z5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FancfE9Q5Z5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms