Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430550D23RikE9Q1X6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms