Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Myo5cE9Q1F5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Myo5cE9Q1F5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Myo5cE9Q1F5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Myo5cE9Q1F5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms