Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc175E9PVB3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms