Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt2E9PUL5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt2E9PUL5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt2E9PUL5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms