Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
4930558K02RikE0CXC6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms